日本が敗戦したあと資料が壊滅的に散失したため、731部隊に関する完全な情報の収集は、歴史研究家による根気強い整理に頼るしかなかった。731部隊の設備が果たしてどのようなものだったのか、今に至るまで確証を持って言える事実はなく、現存する痕跡から当時の規模の壮大さを垣間見ることができるに過ぎない。

日本軍731細菌部隊特別実験場の遺跡

日本軍731部隊遺跡

731の周辺施設は現在まで保存されており、一般にも開放されている。参観客に開放されている731基地のうちの一つは600ヘクタールを占め、150余りの建築物からなる。施設の設計が精密だったため、痕跡が消えにくいのである。

基地は様々な生産設備があった。約4500のノミの飼育容器や、各種化学物質を作る6つのボイラー、約1800の生物薬剤の容器があり、これは数日のうちに約30グラムの腺ペストを作り出すことができた。

これら数十トンの生物兵器（および化学兵器）は戦争期間中を通して中国東北の多くの場所で保存されていた。このため、現在でも地元住民に害を及ぼすことがある。

そして1945年8月、撤退の際に731部隊は現地の主要な実験設備を爆破し、罪状隠滅を図った。